Na území MASMK se nachází 8 evropsky významných lokalit soustavy NATURA 2000: Moravský kras, Údolí Svitavy, Rakovecké údolí, Jižní svahy Hádů, Křtinský kostel, Luční údolí, Protivanov a Stráň nad Huťským potokem.
Kulturní dědictví
Na území MASMK se nacházejí čtyři národní kulturní památky: poutní kostel Jména Panny Marie ve Křtinách, zámek Rájec nad Svitavou, pozdně gotický Světelský oltář z kostela sv. Barbory v Adamově a Stará huť u Adamova.
Na území MASMK se nacházejí dvě ochranná pásma: větrný mlýn v Ruprechtově a dům č. p. 27 v Ježkovicích.